诊断生殖器白色念珠菌病除典型的症状、体征外，实验室检查是必不可少的。
一般作分泌物的直接镜检就可以明确诊断，有条件的也可作白色念珠菌的培养，能更明确诊断。取少许分泌物置于玻璃片上，加一滴氢氧化钾或等渗的氯化钠溶液，覆盖上玻片，置于显微镜下，可见到白色念珠菌的孢子和菌丝。
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